宇宙世紀0079年──。人類が宇宙へ生活圏を拡大してから半世紀以上が過ぎた。地球周辺のラグランジュポイントには「サイド」と呼ばれる巨大なスペースコロニー群が建造され、数十億の人々がその中で暮らしていた。しかし、地球連邦政府による支配は、宇宙に住む人々——スペースノイドたちの不満を募らせていった。

そんな中、地球から最も遠いサイド3は、思想家ジオン・ズム・ダイクンの理想を掲げ「ジオン公国」を宣言。U.C.0079年1月3日、ついに地球連邦政府へ宣戦を布告した。緒戦でジオン軍は新兵器「モビルスーツ」を投入。コロニーを地球上に落下させる「ブリティッシュ作戦」により、数十億の人命が失われた。